Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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