Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmf1B9EKI3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmf1B9EKI3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms