Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm20547B8JJN0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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