Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms