Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabrr3B2RXA8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabrr3B2RXA8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabrr3B2RXA8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabrr3B2RXA8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabrr3B2RXA8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms