Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cspp1B2RX88 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms