Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cped1B2RX70 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms