Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms