Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms