Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apba1B2RUJ5 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms