Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PtprbB2RU80 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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