Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt4B2RU40 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt4B2RU40 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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