Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms