Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ythdc2B2RR83 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms