Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp42B2RQC2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms