Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms