Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H60cB1B213 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H60cB1B213 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms