Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R2

Spin2d, Spindlin family, member 2D, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2dB1B0R2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spin2dB1B0R2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spin2dB1B0R2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms