Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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