Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spocd1B1ASB6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms