Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn9B1ARD6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms