Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms