Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap221A9Q751 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap221A9Q751 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap221A9Q751 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap221A9Q751 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap221A9Q751 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cfap221A9Q751 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms