Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms