Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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