Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms