Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf2A3KGV1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms