Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ism1A2ATD1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ism1A2ATD1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms