Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttll9A2APC3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll9A2APC3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms