Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms