Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ambra1A2AH22 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms