Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34dA2AGU5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34dA2AGU5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms