Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms