Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms