Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdc27A2A6Q5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms