Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms