Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trav12-2A0N8N6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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