Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup205A0A0J9YUD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms