Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms