Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Speer3W4VSP1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms