Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Homer1Q9Z2Y3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer1Q9Z2Y3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms