Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt85Q9Z2T6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt85Q9Z2T6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms