Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms