Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubl3Q9Z2M6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms