Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms