Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms