Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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