Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms