Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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