Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms